近幾年來，随着國(guó)家惠農投入的加大，農業産業化結構的不斷優化，地方種(zhǒng)植業、養殖業、飼養業發(fā)展較快，一些個人獨資企業或合夥企業的生産規模和主營業務收入已超過(guò)集體企業或其它企業。然而，國(guó)家财政部、國(guó)家稅務總局（财稅[2010]96号）規定“對(duì)個人獨資企業和合夥企業從事(shì)種(zhǒng)植業、養殖業、飼養業、捕撈業（以下簡稱‘四業’），其投資者取得的‘四業’所得暫不征收個人所得稅”。對(duì)集體企業從事(shì)“四業”的所得也免征了企業所得稅，而對(duì)集體企業的投資者取得的所得則要交納個人所得稅。顯然，此規定有失公平。
其一，個人獨資企業、合夥企業、集體企業或其它企業從事(shì)“四業”，其經(jīng)營項目、經(jīng)營範圍、經(jīng)營模式基本相同，唯一不同的是注冊登記時企業經(jīng)濟性質不同。比如以個人名義注冊登記的則爲個人獨資企業，以2人名義注冊登記的則爲合夥企業。如果該2人注冊登記爲有限責任公司就要交納個人所得稅。因此，僅憑企業注冊登記時經(jīng)濟性質，以确定個人所得稅的征免是不合理的，也是不公平的。
其二，随着國(guó)民生活水平的提高對(duì)蛋白質食品需求的增加，以及“四業”受基本農田和生态紅線的制約，“四業”的發(fā)展受到限制，農業企業尤其是種(zhǒng)植業、養殖業、飼養業、捕撈業是高風險行業，市場因素很大，加之生産成(chéng)本，主要人工、飼料、土地流轉等費用上漲較快，企業已進(jìn)入微利時代。随着國(guó)家稅收體量的增大，應逐步取消對(duì)集體企業或其它企業從事(shì)“四業”個人所得稅的征收，使從事(shì)“四業”經(jīng)營的集體企業或其它企業同個人獨資企業、合夥企業享受公平競争環境和普惠的稅收免征待遇。
據此，建議修改《國(guó)務院關于個人獨資企業和合夥企業征收所得稅問題的通知》（國(guó)發(fā)[2000]16号）、《财政部 國(guó)家稅務總局關于個人所得稅若幹政策問題的通知》（财稅字[1994]020号）和《國(guó)家财政局、國(guó)家稅務總局關于農村稅費改革試點地區有關個人所得稅問題的通知》（财稅[2004]30号）等有關規定，新增條款“對(duì)集體企業或其他企業從事(shì)‘四業’，其投資者取得的‘四業’所得停止征收個人所得稅”。